
拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC表面抗原生物富集MHC和切合肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫抗体肽字段及译成后淡化信息内容,提高基因测序的真实度,并采用De novo从头至尾测序技术应用,不依赖现有数据库,高些通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且多种的数剧浅析介绍为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!
图1 MHC-I和MHC-II呈递癌肿抗原的途经
NO.1 实践具体步骤
NO.2 服务优势
NO.3 探讨信息(那部分)
NO.4 送样提议
事例分享
01 措施科学研究
篇文章小题目:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells
文章发表半月刊:Science Advances IF:11.7 2024
XPO1 (Exportin-1/CRM1)就是种核传输蛋白质,在恶性肿癌中有时候过描述,做以为肿癌的发生的驱使因素分析。现下,靶向用药XPO1的小原子核正被用于临床实践防癌用药。作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用免疫检测肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。
图2 一类隶属于XPO1的肽是KIR2DS2的配体
02 癌症-天然免疫医治
小文章之类:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors
刊登杂志期刊:Nature Communications IF:16.6 2023
梭形神经细胞良性肿瘤胸膜间皮瘤(MPM)都是种生存率无良的侵入性良性肿瘤。是因为涉及的治愈方案范文匮乏成效,所以说急切需用需用新的治愈原则。采取其T神经细胞浸泡,笔者比如MPM都是个适合的的治愈性恶性肿瘤预防针的的目标。迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用依据质谱的免疫抗体肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。
图3 恶性瘤胸膜间皮瘤免疫力肽组学测试
03 病毒mRNA防疫针定制开发
经典文章题:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes
展现异物:Nature Communications IF:16.6 2023
单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过由于质谱的免疫细胞肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。
图4 在李斯特菌传染的Hela生殖血细胞和HCT-116生殖血细胞中判定MHC I呈递的抗原肽。
拜谱工作小结
免役肽组学是蛋白质酶质组学的一位迅速的壮大的树状,它细心于研发免役机系统中由具体组识相匹配性符合体(MHC)或人类白癌癌细胞核核计数核抗原(HLA)大分子呈递的免役肽。哪些免役肽是癌癌细胞核核核外表呈递的肽段,可以被T癌癌细胞核核核面部识别,关键在于晕人免役反映。鉴于质谱的免役肽组学己经称得上检测MHC蛋白质酶呈递肽的金标准的形式,可以一直检测不相同生理方面和病理学工作状态下不相同组识和癌癌细胞核核核多种类型中的免役肽组,诸如实际瘤或木马病毒影响的癌癌细胞核核核。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的蛋白质组学、基础代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的抗体肽组论文检测的服务,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,才可以准确的且单独能提供免疫抗体系统肽队列,察觉到许多非典型性免疫抗体系统肽,逐级挑选出信得过新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。
参考资料资料
1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y