草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿整体最应见的疫情中之一。肾组织开展中CaOx结晶体过饱和堆积会导至肾小管神经元软组织损伤和凋亡，因而导至肾结石的成型。短链皮脂酸由肠管内活性污泥细菌和病毒发醇营养饮食食物纤维会产生，不仅仅在轮廓线肠管天然屏障中切实引领做用，况且在整体技术水平上也切实引领关键所在做用。这之中，丁酸是最丰厚的短链皮脂酸，都具有抗体促使和抗体促使做用,本分析论述丁酸对CaOx肾结石的做用还有其隐藏的靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山医院口腔科泌尿产科吴忠老师、周子健博士研究生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠专家教授、周子健博土在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物体与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了网药学学服务的，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

好的文章标题：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 老客户厂家：华山的医院 分析人群：大鼠、HK-2细胞系 排序信心：对应组（Con）、模形组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱供给系统：wifi网络临床药理学测试

要点程序流程图模板

研究分析成果

理论研发人员管理要构造 大鼠模式，经由身理生化学统计指标和团体方面的问题学染色的等理论研发具体方法显示丁酸行以减少CaOx模式大鼠肾CaOx结晶体的进行和板材损害，改善CaOx模式大鼠的真菌感染板材损害和钝化有害物质的过早形容。另外，丁酸还可调节草酸分析的HK-2组织血细胞板材损害、钝化应激状态和组织血细胞凋亡。 为探索丁酸型式和靶DNA网洛，理论研究工作人员从PubChem想要高效率的获取到丁酸和丁酸酯的二维和三维立体型式（图1A）。按照PharmMapper数据表格信息文件库和Uniprot数据表格信息文件库除理后共需求出117个丁酸靶DNA供进两步浅析。将DNA索引导出来STRING数据表格信息文件库，来PPI网洛浅析。Cytoscape提供了排列顺序的前20的核心区站靶DNA的详细完整网洛图，还有CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。等等核心区站DNA与网洛中的另一个DNA均突出表现出很大的极为重要性性性，详细说明等等DNA可以充分推动着协同工作能力。GO和KEGG浅析论述了丁酸核心区站DNA的极为重要性性渠道和动物学功能模块（图1C）。核心区站DNA关键与类固醇抗生素回复、钝化应激反映状态回复、生物技术学活化氧组织细胞对类固醇抗生素激发的表现迟钝或是对呈酸性生物技术学成分的表现迟钝有关于。笔者认为归结，等等核心区站DNA关键操作了钝化应激反映状态和对生物技术学活化氧的动物表现迟钝阶段，是肾结石产生共识机制中至关极为重要性的渠道，这阐明丁酸可以在肾结石中充分推动极为重要性能力。

图1| 丁酸结构的与靶染色体在线分折(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进两步挑战丁酸对CaOx肾结石真实切靶染色体组，深入分析一下员回收利用GEO数据显示表格库对GSE73680中安全健康比与CaOx肾结石患病者的染色体组差距来了深入分析一下。比组与CaOx结石患病者的为更为明显性能差距抒发染色体组（DEGs）肿瘤筛查要求为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共建立到3783个染色体组产生为更为明显变换，中间3379个（89.4%）染色体组抒发调整，404个（10.6%）染色体组抒发变动（图2A）。对DEGs来聚类算法分析一下法分析一下，热图表明了前10个被选中DEGs的二维细化聚类算法分析一下法特性（图2B）。随即，深入分析一下员在GeneCards数据显示表格库人工控制司法鉴定了370个会与CaOx肾结石关联的染色体组，网站排名前20位的估计染色体组和关联性评价如图是2C右图。要为找寻丁酸冶疗CaOx肾结石的根本靶点，深入分析一下员将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石关联染色体组解决赢得了个Venn图。终究，CYP2C9被决定为丁酸的影响CaOx肾结石的意向靶点(图2D)。虽然，深入分析一下员还来了丁酸与CYP2C9的大分子嫁接，CYP2C9的二个酪氨酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸充分目的，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在进行网站药学学预測CYP2C9是丁酸反应CaOx肾结石的靶dna后，探究人士还能够 生殖细胞膜实践验证了CYP2C9可削减草酸诱导性的HK-2生殖细胞膜的ROS的水平、慢性炎症影响和凋亡。

图2| 大部分据库合作概述分析预测CYP2C9是丁酸目的于CaOx肾结石的靶dna

探讨最终结果

本分析关键在于发展丁酸在身体外和人体内均能减弱CaOx肾结石三维模型的空气氧化物应激性状态和真菌感染破损，接下来依据手机网洛临床药学学挑选得以丁酸后果CaOx肾结石的暗藏靶点——CYP2C9，接下来依据細胞实验操作可确认CYP2C9在草酸盐诱惑的HK-2細胞ROS水平面、真菌感染破损和凋亡。许多发展证明丁酸或者依据减弱CYP2C9来减弱CaOx肾结石的空气氧化物应激性状态，消减真菌感染破损。此时候中拜谱菌物提供数据了手机网洛临床药学学技能应用工作，前者拜谱菌物可延长成熟稳重建立完善的遗传基因组学、淀粉酶质组学、消化吸收组学等几组学企业产品及技能应用工作，感谢致電资讯！ 参阅专著：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.