
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱怪物 为其提供 TMT球蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
探析数据
设计工作员探究性随着的时期的推移冷冻库的时期拉长鸡肉的坚硬程度、持来说水力、光色、徘徊铁分子量、ROS、脂质过硫化物、MDA、GSH和GPX4水准来评定肌群阻止神经体细胞的铁生亡的情况。结杲出现,冷冻库的时期拉长后,鸡肉的坚硬程度在第5天和第6天为相关系数上升;持水的能力减轻;本色变深,耗尽光滑,鲜灰色的转成暗灰色的。与此同时,徘徊铁、活力氧和MDA的分子量为相关系数增大,神经体细胞凋亡率为相关系数增大。 探究技术人员取出之间的关系要在冷藏室保存期限的肩部肌肉群合格品的球营养素,随后实行SDS-PAGE进行定性分析,球营养素条带在之间的关系阶段分布不均平滑且似的(图1a)。据球核蛋清在之间的关系合格品中的展示条件,进行定性分析发展同个组合格品的中个数贴近于同个总体水平(图1b),反映肩部肌肉群合格品球营养素存在非常好的组内似的性和组间之间的关系性。 蛋清质组学共签定出1996种蛋清质。以B0为较组,选择B1、B2、B4和B6中的蛋清做出地域不同之处表述研究定量分析,共签定到37几个DEPs。将火山图web3d,并按照FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.055个标准研究定量分析DEP。但是提示 长为1c-f图甲中,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中别签定出22、33、73和140个DEPs,进来别上浮6、11、32和85个,下降16、22、41和58个。聚类算法方案测试了有所不同食品冷藏阶段中,腿部相关肌肉聚集中蛋清质的表述,但是提示 提示 腿部相关肌肉蛋清表述地域不同之处跟随保存时期的延长而延长(图1g)。
图1| 不同于冷冻时的身体肌肉试品球蛋白质含量组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 多种冰箱日期的身体肌肉样机差距淀粉酶数据分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁消亡核蛋白肽的PRM按量进行分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 立于KEGG聚集差别抒发蛋清的铁枯死原则(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱工作小结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物工程提供了TMT化学发光法球膳食纤维组学技巧保障,拜谱生物制品已產品开发顺利完成并开发了建全成孰的转录组学、球蛋白质组学、排泄组学以其两组学结合產品技巧保障风险管理体系,欢迎致电咨询!
关联性学术论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.